Naxçıvan Musiqi kolleci 30 aprel 2012-ci ilədək Azərbaycan Respublikası Təhsil Nazirliyinin tabeliyində
olmuş,həmin vaxtdan Azərbaycan Respublikası Nazirlər Kabinetinin Qərarı ilə Naxçıvan Muxtar Respublikası
Təhsil Nazirliyinin tabeliyinə verilmişdir
Hal-hazırda Naxçıvan Musiqi Kolleci Naxçıvan Dövlət
Universitetinin nəzdində fəaliyyət göstərir.